Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK1A1P48729 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1A1P48729 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1A1P48729 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms