Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR1BP42025 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1BP42025 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms