Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.3 ms