Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms