Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DGG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DGG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DGG1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DGG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DGG1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DGG1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DGG1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DGG1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DGG1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B4DGG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B4DGG1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DGG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DGG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DGG1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DGG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DGG1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DGG1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DGG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DGG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DGG1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DGG1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DGG1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DGG1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DGG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DGG1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DGG1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DGG1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DGG1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DGG1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DGG1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4DGG1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4DGG1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms