Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6CA6NDK9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6CA6NDK9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms