Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDP1Q9P0J1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms