Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC17Q9NVM6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC17Q9NVM6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms