Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP4R4Q6NUP7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms