Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3C1V9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3C1V9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3C1V9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3C1V9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3C1V9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Q3C1V9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Q3C1V9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Q3C1V9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3C1V9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3C1V9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3C1V9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3C1V9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3C1V9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3C1V9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3C1V9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3C1V9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3C1V9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3C1V9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3C1V9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3C1V9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3C1V9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3C1V9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3C1V9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3C1V9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3C1V9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3C1V9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3C1V9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3C1V9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3C1V9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3C1V9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3C1V9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3C1V9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3C1V9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3C1V9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Q3C1V9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Q3C1V9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3C1V9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3C1V9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3C1V9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3C1V9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3C1V9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3C1V9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3C1V9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3C1V9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3C1V9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3C1V9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3C1V9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3C1V9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3C1V9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3C1V9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q3C1V9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q3C1V9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms