Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMED1Q13445 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED1Q13445 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED1Q13445 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED1Q13445 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED1Q13445 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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