Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB2Q13425 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTB2Q13425 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms