Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TPM4P67936 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TPM4P67936 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM4P67936 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM4P67936 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM4P67936 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM4P67936 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM4P67936 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM4P67936 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM4P67936 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM4P67936 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM4P67936 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPM4P67936 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPM4P67936 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM4P67936 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM4P67936 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM4P67936 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM4P67936 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM4P67936 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM4P67936 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM4P67936 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM4P67936 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM4P67936 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM4P67936 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM4P67936 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM4P67936 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM4P67936 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM4P67936 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM4P67936 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM4P67936 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM4P67936 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM4P67936 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM4P67936 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM4P67936 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM4P67936 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM4P67936 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM4P67936 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM4P67936 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM4P67936 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM4P67936 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM4P67936 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms