Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
S100A1P23297 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
S100A1P23297 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
S100A1P23297 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
S100A1P23297 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
S100A1P23297 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
S100A1P23297 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
S100A1P23297 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
S100A1P23297 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
S100A1P23297 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
S100A1P23297 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
S100A1P23297 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
S100A1P23297 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
S100A1P23297 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
S100A1P23297 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
S100A1P23297 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
S100A1P23297 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
S100A1P23297 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
S100A1P23297 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
S100A1P23297 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
S100A1P23297 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
S100A1P23297 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
S100A1P23297 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
S100A1P23297 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
S100A1P23297 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
S100A1P23297 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
S100A1P23297 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
S100A1P23297 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
S100A1P23297 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
S100A1P23297 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
S100A1P23297 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
S100A1P23297 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
S100A1P23297 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
S100A1P23297 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
S100A1P23297 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
S100A1P23297 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
S100A1P23297 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
S100A1P23297 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
S100A1P23297 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
S100A1P23297 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
S100A1P23297 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
S100A1P23297 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
S100A1P23297 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
S100A1P23297 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
S100A1P23297 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
S100A1P23297 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
S100A1P23297 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
S100A1P23297 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
S100A1P23297 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
S100A1P23297 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms