Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1P21675 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1P21675 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1P21675 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1P21675 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1P21675 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TAF1P21675 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TAF1P21675 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1P21675 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1P21675 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1P21675 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1P21675 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1P21675 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1P21675 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1P21675 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1P21675 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1P21675 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1P21675 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1P21675 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1P21675 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1P21675 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1P21675 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1P21675 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1P21675 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1P21675 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1P21675 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1P21675 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1P21675 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1P21675 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1P21675 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1P21675 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1P21675 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TAF1P21675 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TAF1P21675 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1P21675 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1P21675 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1P21675 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1P21675 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1P21675 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1P21675 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1P21675 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1P21675 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1P21675 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1P21675 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1P21675 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms