Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VIL1P09327 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VIL1P09327 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VIL1P09327 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIL1P09327 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VIL1P09327 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VIL1P09327 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIL1P09327 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIL1P09327 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIL1P09327 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIL1P09327 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIL1P09327 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIL1P09327 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VIL1P09327 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VIL1P09327 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VIL1P09327 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VIL1P09327 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VIL1P09327 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VIL1P09327 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VIL1P09327 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VIL1P09327 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VIL1P09327 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VIL1P09327 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VIL1P09327 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VIL1P09327 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VIL1P09327 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VIL1P09327 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VIL1P09327 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VIL1P09327 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VIL1P09327 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VIL1P09327 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIL1P09327 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms