Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLIN3O60664 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLIN3O60664 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms