Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APPL1Q9UKG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL1Q9UKG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms