Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHD7Q9P2D1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms