Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms