Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms