Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.9 ms