Protein–RNA interactions for Protein: Q8N695

SLC5A8, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A8Q8N695 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC5A8Q8N695 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 868 ms