Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
LMOD2Q6P5Q4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD2Q6P5Q4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD2Q6P5Q4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms