Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN8Q6JVE9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN8Q6JVE9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms