Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTB1Q13884 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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