Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAPC2Q13487 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAPC2Q13487 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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