Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPP55072 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPP55072 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPP55072 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPP55072 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPP55072 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPP55072 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPP55072 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCPP55072 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPP55072 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPP55072 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPP55072 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPP55072 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCPP55072 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCPP55072 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPP55072 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPP55072 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPP55072 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPP55072 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPP55072 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCPP55072 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPP55072 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPP55072 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPP55072 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPP55072 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPP55072 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPP55072 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCPP55072 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCPP55072 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCPP55072 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCPP55072 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCPP55072 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPP55072 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPP55072 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPP55072 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPP55072 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPP55072 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCPP55072 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms