Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3AP49840 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3AP49840 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms