Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP13P45452 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP13P45452 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP13P45452 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP13P45452 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP13P45452 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP13P45452 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP13P45452 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP13P45452 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP13P45452 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP13P45452 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP13P45452 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP13P45452 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP13P45452 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP13P45452 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP13P45452 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP13P45452 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP13P45452 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP13P45452 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP13P45452 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP13P45452 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP13P45452 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP13P45452 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP13P45452 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP13P45452 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP13P45452 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP13P45452 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP13P45452 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP13P45452 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP13P45452 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP13P45452 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP13P45452 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms