Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms