Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR7P32248 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR7P32248 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR7P32248 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR7P32248 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR7P32248 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR7P32248 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR7P32248 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR7P32248 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR7P32248 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR7P32248 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR7P32248 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCR7P32248 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR7P32248 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR7P32248 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR7P32248 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR7P32248 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR7P32248 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR7P32248 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR7P32248 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR7P32248 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR7P32248 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR7P32248 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR7P32248 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR7P32248 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR7P32248 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR7P32248 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR7P32248 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR7P32248 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCR7P32248 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCR7P32248 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR7P32248 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR7P32248 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR7P32248 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR7P32248 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR7P32248 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR7P32248 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR7P32248 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR7P32248 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR7P32248 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR7P32248 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR7P32248 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR7P32248 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR7P32248 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR7P32248 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR7P32248 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR7P32248 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms