Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNI3P19429 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms