Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUX1O43812 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUX1O43812 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUX1O43812 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUX1O43812 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUX1O43812 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUX1O43812 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX1O43812 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX1O43812 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX1O43812 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX1O43812 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX1O43812 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX1O43812 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX1O43812 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX1O43812 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX1O43812 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX1O43812 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX1O43812 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUX1O43812 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUX1O43812 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUX1O43812 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUX1O43812 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX1O43812 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX1O43812 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX1O43812 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX1O43812 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX1O43812 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX1O43812 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX1O43812 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX1O43812 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms