Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1GO43497 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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