Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
MED17Q9NVC6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms