Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-203ENST00000494757 2113 ntTSL 1 (best)22.88■■□□□ 1.251e-8■■■■■ 402.5
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.021e-8■■■■■ 402.5
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 402.5
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-206ENST00000582781 3163 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 402.5
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 402.5
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-208ENST00000583268 581 ntTSL 312.22□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 402.5
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-207ENST00000583130 1529 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 402.5
UTP3Q9NQZ2 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 402.4
UTP3Q9NQZ2 NSMCE1-208ENST00000565070 1853 ntTSL 513.53□□□□□ -0.245e-8■■■■■ 402.4
UTP3Q9NQZ2 NSMCE1-214ENST00000569236 1782 ntTSL 213.36□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 402.4
UTP3Q9NQZ2 NSMCE1-204ENST00000563273 626 ntTSL 312.91□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 402.4
UTP3Q9NQZ2 NSMCE1-211ENST00000566087 878 ntTSL 511.28□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 402.4
UTP3Q9NQZ2 NSMCE1-203ENST00000562039 260 ntTSL 310.2□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 402.4
UTP3Q9NQZ2 DLG5-210ENST00000489547 861 ntTSL 315.39■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 401
UTP3Q9NQZ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 400.9
UTP3Q9NQZ2 MAP7D1-210ENST00000527764 945 ntTSL 219.63■□□□□ 0.738e-9■■■■■ 400
UTP3Q9NQZ2 MAP7D1-205ENST00000429533 959 ntTSL 319.48■□□□□ 0.718e-9■■■■■ 400
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-211ENST00000598240 3235 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 399.6
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-220ENST00000614176 6384 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 399.6
UTP3Q9NQZ2 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 319.66■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 398.6
UTP3Q9NQZ2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.93e-14■■■■■ 398.4
UTP3Q9NQZ2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-14■■■■■ 398.4
UTP3Q9NQZ2 PACS2-211ENST00000551692 3453 ntTSL 214.57□□□□□ -0.085e-10■■■■■ 398.3
UTP3Q9NQZ2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 325.76■■□□□ 1.712e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 518.76■□□□□ 0.592e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-209ENST00000599786 749 ntTSL 418.07■□□□□ 0.482e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 317.53■□□□□ 0.42e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 416.8■□□□□ 0.282e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 JMJD4-204ENST00000480590 891 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 JMJD4-205ENST00000485807 3749 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-210ENST00000590906 534 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 TTC14-203ENST00000412756 4568 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 TTC14-205ENST00000465065 7052 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.552e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 TTC14-201ENST00000296015 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-210ENST00000508841 610 ntTSL 510.8□□□□□ -0.682e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 TTC14-207ENST00000470669 3150 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.832e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-212ENST00000511198 444 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.892e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-203ENST00000503255 486 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.152e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-206ENST00000506516 473 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.172e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-209ENST00000508618 388 ntTSL 27.36□□□□□ -1.232e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-215ENST00000513677 221 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.242e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-214ENST00000513557 277 ntTSL 1 (best)6.7□□□□□ -1.342e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-204ENST00000504951 632 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.392e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-205ENST00000505583 583 ntTSL 1 (best)6.2□□□□□ -1.422e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-208ENST00000507009 388 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.432e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-211ENST00000510196 508 ntTSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.512e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.512e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-207ENST00000506679 606 ntTSL 1 (best)5.53□□□□□ -1.522e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.562e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.632e-23■■■■■ 397.5
UTP3Q9NQZ2 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 397.4
UTP3Q9NQZ2 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 397.4
UTP3Q9NQZ2 PRKCH-213ENST00000555185 582 ntTSL 39.17□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 397.4
UTP3Q9NQZ2 PRMT7-211ENST00000563608 626 ntTSL 515.13■□□□□ 0.016e-9■■■■■ 396.9
UTP3Q9NQZ2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-15■■■■■ 396.8
UTP3Q9NQZ2 DSTYK-203ENST00000615388 1042 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-13■■■■■ 395.9
UTP3Q9NQZ2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 394.9
UTP3Q9NQZ2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 18e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-213ENST00000521385 2320 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-206ENST00000483364 2362 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-209ENST00000518913 2663 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-211ENST00000520970 4333 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-205ENST00000471755 2695 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.158e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-212ENST00000520982 3244 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 BMP1-210ENST00000520626 3925 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 394
UTP3Q9NQZ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.847e-8■■■■■ 393.9
UTP3Q9NQZ2 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.887e-8■■■■■ 393.9
UTP3Q9NQZ2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 393.9
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-204ENST00000451615 795 ntTSL 513.03□□□□□ -0.327e-11■■■■■ 393.7
UTP3Q9NQZ2 GLS-213ENST00000479552 2016 ntTSL 1 (best)26.89■■□□□ 1.898e-11■■■■■ 392.5
UTP3Q9NQZ2 GLS-215ENST00000496170 673 ntTSL 325.26■■□□□ 1.638e-11■■■■■ 392.5
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-218ENST00000584650 2087 ntTSL 222.61■■□□□ 1.214e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.824e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.614e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 218.82■□□□□ 0.64e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.54e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-205ENST00000465825 2793 ntTSL 217.85■□□□□ 0.454e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.41e-31■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 217.31■□□□□ 0.364e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 AC020915.1-203ENST00000610038 669 ntAPPRIS P5 TSL 517.06■□□□□ 0.324e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.234e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.194e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.134e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 AC020915.1-206ENST00000609864 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.76■□□□□ 0.114e-21■■■■■ 391.3
UTP3Q9NQZ2 PSMC4-205ENST00000601194 650 ntTSL 315.26■□□□□ 0.033e-30■■■■■ 391.3
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