Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms