Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRELD1Q96HD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRELD1Q96HD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRELD1Q96HD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms