Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC47Q96A33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC47Q96A33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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