Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPUSD2Q8IZ73 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPUSD2Q8IZ73 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPUSD2Q8IZ73 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.5 ms