Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01551Q86U37 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01551Q86U37 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms