Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KRT28Q7Z3Y7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KRT28Q7Z3Y7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KRT28Q7Z3Y7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms