Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD2Q6P5Q4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD2Q6P5Q4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD2Q6P5Q4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms