Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NHSL1Q5SYE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NHSL1Q5SYE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms