Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOHLH1Q5JUK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOHLH1Q5JUK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms