Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ETDBQ3ZM63 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETDBQ3ZM63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms