Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
SHROOM2Q13796 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SHROOM2Q13796 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SHROOM2Q13796 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
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