Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1T1Q06455 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1T1Q06455 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms