Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVS71-1P61550 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms